На главную страницу второго семестра

Консервативные аминокислотные остатки в выборке 4 потенциальных ортологов белка PHOB_ECOLI

Матрица попарного сходства

              PHOB_ECOLI   PHOB_PSEAE   PHOB_HAEIN   PHOB_RHIME

  PHOB_ECOLI        100%

  PHOB_PSEAE         61%         100%

  PHOB_HAEIN         51%          46%         100%

  PHOB_RHIME         47%          45%          36%         100%

Множественное выравнивание

Цвета, отвечающие степени консервативности колонок:

синий — 100% идентичности
зеленый — более 80% идентичности

Консервативность участков белка PHOB_ECOLI, взаимодействующих с ДНК

Изображение 3D-структуры белка PHOB_ECOLI

* Цвета консервативных аминокислотных остатков в белке соответствуют цветам в вышеуказаном множественном выравнивании.

Степень консервативности аминокислотных остатков белка PHOB_ECOLI, находящихся на расстоянии 5 ангстрем от ДНК (определена по вышеуказанному множественному выравниванию):

MET155,THR221 —неконсервативны

GLY156,PRO157,TYR189,GLU191,VAL197,HIS198,ARG200,SER175,ILE199,LYS204 — более 80% консервативности

THR158,GLU159,ARG176,TRP184,VAL190,ARG193,THR194,ASP196,ARG201,ARG203,THR217,VAL218,ARG219, GLY220,GLY222,TYR223 — 100% консервативности

Смотря на полученные результаты, можно предположить, что большинство из этих аминокислотных остатков являются строго консервативными для белка PHOB_ECOLI и его трех ортологов. Вероятно, хотя бы часть из этих аминокислотных остатков участвует в транскрипционной регуляции фосфатного регулона (функция, выполняемая каждым из четырех ортологов).